Anh lonxon giải trình tự toàn bộ genome của Cryptophyta àh? hệ gene của nó có lớn ko? bằng bao nhiêu phần của Arabidopsis?
Follow along with the video below to see how to install our site as a web app on your home screen.
Note: This feature may not be available in some browsers.
lonxon said:cái tui làm là thằng Chloroplast ấy, có chừng 100 đến 120 kb thôi, nên 1 mình tui làm nổi.
Anh cắt thành bao nhiêu đoạn ? Mỗi đoạn khoảng bao nhiêu nucleotides ? Làm trong khoảng thời gian bao lâu thì xong ? Tốn bao nhiêu $cái tui làm là thằng Chloroplast ấy, có chừng 100 đến 120 kb thôi, nên 1 mình tui làm nổi.
Cái đơn vị Mb và Mn là thế nào đấy ạ ? Em không biết những đơn vị này.Nuclear: 540 Mb
Ty thể: 40 kb
Nucleomorph: 310 Mn
Chloroplast: 120 kb
lonxon said:tách riêng plastome, làm genome library rồi mới sequencing
lonxon said:dùng PCR là một pp đã được nghĩ tới, nhưng nó kô hay và người làm Ph.D sẽ kô học được nhiều techniques (là điều quan trọng với 1 Ph.D student).
lonxon said:Câu 1: Câu này không rõ lắm, nếu tui hiểu đúng ý bạn thì ý bạn hỏi là lục lạp của sinh giới có chung 1 nguồn gốc hay nhiều nguồn. Không. Các nhóm sinh vật (tảo, thực vật) khác nhau có thể có lục lạp từ những nguồn khác nhau. Mặc dù thủy tổ của lục lạp là 1 Proka (giả định là cyanobacteria) nhưng quá trình tiến hóa đã khiến cho chúng phát triển thành nhiều "dòng" lục lạp khác nhau.
Câu 2: Trên Annual Review Plant, có 2 bài về di truyền của ty thể và lục lạp khá hay. Nếu bạn thật sự cần, tôi sẽ chuyển cho đọc.
Câu 3: tiếp cận genome của ty thể (động vật) hay lục lạp (thực vật và tảo) vì hai genome này có độ bảo tồn cao hơn hẳn so với nuclear genome. Ở chúng kô có hiện tượng tái tổ hợp nên chúng khá bảo thủ. Thực tế, người ta dùng ty thể và lục lạp để dò tìm thêm bằng chứng ủng hộ cho 1 giả thuyết nào đó mà đôi khi genome nhân không cung cấp đủ.
Câu 4: genome lục lạp chỉ khỏang 120 kb, có thể cao hơn hoặc thấp hơn chút đỉnh. Phân lọai dưới lọai là câu hỏi đang làm nhiều nhà khoa học tốn công sức tìm ra một cái gọi là "chuẩn chung" để tiến hành phân lọai. Genome lục lạp cũng là 1 ứng cử viên cho cái chuẩn này, vì còn nhiều ý kiến khác đề nghị sử dụng những yếu tố khác. Vấn đề này chưa ngã ngũ, chỉ phụ thuộc từng đối tượng nghiên cứu và lab làm trên chuẩn nào mà thôi.
Câu 5: Thật ra tui giải lục lạp genome không phải để ... phân lọai. Vì nếu phân lọai 1 lòai mà phải đọc đến genome 1 lòai thì coi bộ cả thế giới phải xúm vô làm chứ kô chỉ có máy "nhà pha học phân lọai học phân tử" làm. Thực tế công việc tui làm đúng là giải trình tự lục lạp genome, nhưng sau đó tui sẽ so sánh nó với một lục lạp genome của 1 lòai tương cận khác đã được giải trình rồi, từ đó phân tích để thấy sự khác biệt giữa hai genome này. Sự khác nhau này giúp tui trả lời câu hỏi "Tại sao có A, A từ đâu tới" (A là lòai tui đang làm) hoặc "Tại sao A khác biệt với bà con họ hàng của nó". Về phần mềm sử dụng thì có thể sử dụng các công cụ hiện hành mà dân Molecular Evolution đang dùng như PaulPhylip*... hoặc có thể dùng tạm VectorNTI cũng được.
Anh cho em biết chính xác hơn lỗi nó báo như thế nào được không? Em thì vẫn down bình thường mà.to dontcry tại sao anh dl từ các file attach ở 4rum mà ko được nhỉ, em check lại nhé