Trong đoạn trích dẫn ở trên, tôi đồng ý với tác giả là khi sản phẩm PCR tăng lên thì số phân tử các sợi đơn của sản phẩm PCR tự gắn lại với nhau sẽ tăng lên. Tuy nhiên, từ kết luận này không thể đương nhiên suy ra: số phân tử sản phẩm PCR được gắn mồi sẽ giảm đi. Điều này có nghĩa là không kết luận được tốc độ phản ứng giảm, hay không giải thích được giai đoạn bão hòa của phản ứng PCR.
Tác giả suy luận không sai. Template dài hơn primer --> Tm của template (vi du la 55oC) cao hơn Tm của primer (vi du 50oC) --> tại 55oC các template đã có thể gắn với nhau, tới 50oC thì ít primer có thể truy cập tới template hơn.
Vậy vì sao điều này không xảy ra ngay từ đầu, mà phải đến khi tỷ lệ primer/sản phẩm giảm? Khi tỷ lệ này cao, tức rất nhiều primer/sản phẩm --> template khó gặp nhau, nhưng lại dễ gặp primer hơn để mà bắt cặp. Khi tỷ lệ này giảm --> các template dễ gặp nhau để bắt cặp hơn.