Chức năng của các yếu tố promoter lõi

[Nguyễn Xuân Hưng]

Functional characterization of core promoter elements: DPE-specific transcription requires the protein kinase CK2 and the PC4 coactivator.
Lewis BA, Sims RJ, Lane WS, Reinberg D
Mol Cell 2005 May 13 18(4):471-81

http://www.facultyof1000.com/article/15893730
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/...ds=15893730&dopt=Abstract&holding=f1000,hulib

F1000 Factor 9.0

Dinah Singer
National Cancer Institute, National Institutes of Health (NIH), United States of America
IMMUNOLOGY

In contrast to the prevailing view that transcription initiation depends solely on the assembly of a preinitiation complex (PIC) nucleated by the transcription factor TFIID into which the remaining general transcription factors (GTFs) and Pol II are recruited, this study demonstrates that the protein kinase CK2 and the coactivator PC4 are additionally required both in vitro and in vivo on those promoters containing a downstream promoter element (DPE). This study documents the plasticity of promoter architecture and the diversity of transcription factors that are required to assemble active PICs on different promoters.

Evaluated 19 Jul 2005

Quan điểm phổ biến là sự khởi đầu phiên mã chỉ phụ thuộc vào quá trình lắp ghép của phức hệ tiền phiên mã (PIC) trong nhân bởi yếu tố phiên mã TFIID, sau đó các yếu tố phiên mã thông thường (GTFs) và Pol II còn lại được tuyển mộ vào phức hệ này. Tuy nhiên trong nghiên cứu này cho thấy protein kinase CK2 và chất đồng hoạt hóa PC4 là các yếu tố cần thêm vào cả ở in vitro và in vivo với các promoter này chứa một yếu tố promoter xuôi dòng (DPE). Nghiên cứu này ghi nhận tính mềm dẻo của kiến trúc promoter và tính đa dạng của các yếu tố phiên mã, điều này cần để lắp ghép các PICs có hoạt tính trên các promoter khác nhau.

 

[Cao Xuân Hiếu]

In contrast to the prevailing view that transcription initiation depends solely on the assembly of a preinitiation complex (PIC) nucleated by the transcription factor TFIID into which the remaining general transcription factors (GTFs) and Pol II are recruited, this study demonstrates that the protein kinase CK2 and the coactivator PC4 are additionally required both in vitro and in vivo on those promoters containing a downstream promoter element (DPE). This study documents the plasticity of promoter architecture and the diversity of transcription factors that are required to assemble active PICs on different promoters.

Quan điểm phổ biến là sự khởi đầu phiên mã chỉ phụ thuộc vào quá trình lắp ghép của phức hệ tiền phiên mã (PIC) trong nhân bởi yếu tố phiên mã TFIID, sau đó các yếu tố phiên mã thông thường (GTFs) và Pol II còn lại được tuyển mộ vào phức hệ này. Tuy nhiên trong nghiên cứu này cho thấy protein kinase CK2 và chất đồng hoạt hóa PC4 là các yếu tố cần thêm vào cả ở in vitro và in vivo với các promoter này chứa một yếu tố promoter xuôi dòng (DPE). Nghiên cứu này ghi nhận tính mềm dẻo của kiến trúc promoter và tính đa dạng của các yếu tố phiên mã, điều này cần để lắp ghép các PICs có hoạt tính trên các promoter khác nhau.

Phức hệ tiền phiên mã có hạt nhân (yếu tố trung tâm) là TFIID sau đó mới đắp thêm GTFs và Pol II. Câu tiếng Anh là ? ? " Subject depends on PIC (that was) nucleated by TFIID".

Downstream core promoter elements are an expanding class of regulatory sequences that add considerable diversity to the promoter architecture of RNA polymerase II-transcribed genes. We set out to determine the factors necessary for downstream promoter element (DPE)-dependent transcription and find that, against expectations, TFIID and the GTFs are not sufficient. Instead, the protein kinase CK2 and the coactivator PC4 establish DPE-specific transcription in an in vitro transcription system containing TFIID, Mediator, and the GTFs. Chromatin immunoprecipitation analyses using the DPE-dependent IRF-1 and TAF7 promoters demonstrated that CK2, and PC4 are present on these promoters in vivo. In contrast, neither PC4 nor CK2 were detected on the TAF1-dependent cyclin D promoter, which contains a DCE type of downstream element. Our findings also demonstrate that CK2 activity alters TFIID-dependent recognition of DCE sequences. These data establish that CK2 acts as a switch, converting the transcriptional machinery from functioning on one type of downstream element to another.

Một lần nữa gợi ý casper nên đưa phần abstract vào (có thể dịch hoặc ko) vì nó mới đại diện được kết quả nghiên cứu chứ cái comment chỉ nói được ý nghĩa.

Theo abstract, sự có mặt của bộ TFIID và GTFs là ko đủ để khởi đầu phiên mã, cần các yếu tố xuôi dòng (hạ nguồn) với sự tham gia của CK2 và PC4. Điều này chỉ đúng với các promoter có chứa DPE. Giả thuyết đặt ra là CK2 hoạt động như 1 công tắc để chuyển đổi bộ máy phiên mã với các yếu tố xuôi dòng khác nhau.

Cũng xin anh lonxon bản full của bài này (cám ơn vì đã thêm bài review của bài Peroxisome). Chẳng hiểu các ông trường em nghĩ gì khi bỏ Cell ra khỏi danh sách tạp chí cần mua .

 

[Trần Hoàng Dũng]

nó đây

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Một lần nữa gợi ý casper nên đưa phần abstract vào (có thể dịch hoặc ko) vì nó mới đại diện được kết quả nghiên cứu chứ cái comment chỉ nói được ý nghĩa.

Biết thế nên tôi đã dán cái link đến abstract rồi mà. Việc copy lên đây sẽ tốn diện tích, vì abstract có thể truy cập miễn phí qua link tôi đã paste lên.

Tôi có một ý thế này, các bài đã được đánh giá trên F1000 đa phần tôi và bác lonxon có thể lấy được. Nên theo ý tôi nếu bác nào quan tâm, muốn đọc fulltext thì mong rằng sau khi đọc xong bác đó post lên đây một vài điều tâm đắc để anh em thảo luận thêm. Đằng nào thì cũng một công đọc mà.

Tức là thế này, tôi dịch từ F1000 --> một bác thấy đúng vấn đề mình quan tâm, cần fulltext --> bác đó post đơn đặt hàng lên đây --> tôi hoặc bác lonxon sẽ dán lên cái fulltext --> bác quan tâm ngồi đọc, post vài điều tâm đắc --> anh em thảo luận. ok?

Không biết bác lonxon có cảm nghĩ giống tôi không khi đa phần các bài dịch ra và post lên không thấy có phản hồi gì cả. Thôi kệ, cứ làm như ông Khương (hehe không phải khuongaquatic đâu nhé, Khương Tử Nha cơ) ngồi câu cá vậy.

 

[Nguyễn Trần Linh]

Liệu có áp dụng trong công nghệ dược phẩm ko?