Length of linker between 2 proteins

[Huỳnh Chấn Khôn]

Chào các anh chị và các bạn,
Các anh chị cho em hỏi vấn đề này: Khi muốn gắn 1 linker giữa 2 protein để giúp quá trình folding tốt hơn thì một trong những yếu tố quan trọng là độ dài của linker. Em muốn hỏi là làm sao mình có thể xác định được độ dài bao nhiêu amino acid thì thích hợp cho protein của mình?
Cảm ơn.

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Không có cách nào khác ngoài thực nghiệm cả.

 

[Huỳnh Chấn Khôn]

Hic hic...

 

[Lê Tiến Dũng]

Chào các anh chị và các bạn,
Các anh chị cho em hỏi vấn đề này: Khi muốn gắn 1 linker giữa 2 protein để giúp quá trình folding tốt hơn thì một trong những yếu tố quan trọng là độ dài của linker. Em muốn hỏi là làm sao mình có thể xác định được độ dài bao nhiêu amino acid thì thích hợp cho protein của mình?
Cảm ơn.

Hi,
cái này ko những phụ thuộc vào độ dài mà còn phụ thuộc vào bản chất của a.a đó.

Mình đã từng thử ok với 2 và 3 residues . . . tuy nhiên bạn nên kiểm tra xem 2 đầu bạn định nối vào nhau nó có cấu trúc gì, nếu là flexible loop thì 2-3 residues là ok, vì bản thân nó đã linh động rồi, còn nếu là betaa hay alpha thì có thể bạn phải dùng đoạn linker dài hơn.

Cứ thử thì mới biết nhưng mà nếu có thêm thông tin thì có thể hạn chế những trial ko cần thiết!