Mình đang nghiên cứu về phần mềm NTSYSpc phiên bản 2.1. Hiện mình đã có được chương trình và cuốn hướng dẫn bằng tiếng Anh. Mình đã đọc và nghiên cứu thì hiểu được đó là phần mềm dùng để phân tích sự đa dạng đặc điểm di truyền dựa vào kỹ thuật PCR mẫu DNA + điện di nhưng vẫn ko biết được cách sử dụng nó như thế nào???.
Anh/Chị hay bạn nào biết cách sử dụng thì chỉ mình với. Mình xin cảm ơn!!
(Note: mình ko phải là dân Sinh-tin nên đọc tài liệu hướng dẫn ko hiểu gì hết !!!)
Chào bạn
Theo tôi hiểu thì đây là phần mềm được dùng để đánh giá độ tương đồng về 'DNA band profiles' của các chủng nghiên cứu ( Ví dụ như vi sinh vật...). Qua đó, nhóm chúng vào các nhóm khác nhau (distinct clusters) va thể hiện chúng trên cái 'dendrogram'
Đây là một công cụ nghiên cứu hỗ trợ cho việc phân tích các số liệu về 'typing method' của một loài nào đó. Đặc biệt rất quan trọng trong nghiên cứu về dịch tễ học (Epidemiology)
Từ các kết quả điện di của phương pháp PCR như; AFLP, RFLP, RAPD, ribotying... hoặc PFGE, ta sẽ thu được các 'DNA band profiles' khác nhau. Sau đó sử dụng các phương pháp tính toán; Dice coefficient hay Pearson correlation coeficient, ta sẽ tính được độ tương đồng của các 'DNA band profiles'. Cuối cùng, ta sẽ sử dụng thuật toán UPGMA để xây dựng cái 'dendogram' cho các DNA band profiles đó. So sánh mối liên hệ của các chủng nghiên cứu.
Thông thường, mình hay thấy người ta sử dụng phần mềm BioNumerics hay GelCompare để phân tích.
Nếu có thể, bạn cho mình xin một bản copy về phần mềm NTSYSpc và bản 'hướng dẫn sử dụng trước khi dùng' của phần mềm đó? Mình sẽ cùng tham khảo và thảo luận với bạn.
Best wishes
