Aspergillus niger, được sử dụng rất rộng rãi trong CNSH để sản xuất phụ gia thực phẩm, các enzyme dùng trong công nghiệp và dược phẩm. Ngoài ra loài này còn được sử dụng để sản xuất protein ngoại lai và axit citric, axit gluconic cũng như có tiềm năng ứng dụng trong phân hủy sinh học. Việc giải trình tự bộ gene của A. niger sẽ giúp phát triển các sản phẩm mới cũng như cải thiện hiệu quả quá trình của các chủng đang được ứng dụng.
Trên tờ Nature Biotechnology số mới đây đã đăng công trình giải trình tự và phân tích toàn bộ bộ gene của A. niger. Đặc biệt, dựa vào trình tự bộ gene, các tác giả đã mô tả chi tiết những thành tố trong con đường tiết protein và xây dựng lại mạng lưới trao đổi chất của loài này (gồm 1.069 phản ứng, trung đó 733 phản ứng được xây dựng dựa vào các tài l iệu đã công bố và 832 phản ứng dựa vào dữ liệu bộ gene, có 570 phản ứng trùng nhau).
Kích thước bộ gene (Mb) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?33,9
Thành phần GC (%) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 50,4
Số gene mã hóa protein (tổng số) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14.165
Số gene mã hóa protein (< 100 aa) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?927
Thành phần GC của các gene mã hóa protein (%) ? ? ? ? ? ?53,4
Chiều dài trung bình của một gene ?(bp) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.572
Mật độ gene (số gene/kb) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?0,42
Số lượng intron trung bình trên một gene ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?2,57
Kích thước trung bình của một intron (bp) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 97
Kích thước trung bình của một exon (bp) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?370
Số gene mã hóa tRNA ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 269
Trên tờ Nature Biotechnology số mới đây đã đăng công trình giải trình tự và phân tích toàn bộ bộ gene của A. niger. Đặc biệt, dựa vào trình tự bộ gene, các tác giả đã mô tả chi tiết những thành tố trong con đường tiết protein và xây dựng lại mạng lưới trao đổi chất của loài này (gồm 1.069 phản ứng, trung đó 733 phản ứng được xây dựng dựa vào các tài l iệu đã công bố và 832 phản ứng dựa vào dữ liệu bộ gene, có 570 phản ứng trùng nhau).
Kích thước bộ gene (Mb) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?33,9
Thành phần GC (%) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 50,4
Số gene mã hóa protein (tổng số) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14.165
Số gene mã hóa protein (< 100 aa) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?927
Thành phần GC của các gene mã hóa protein (%) ? ? ? ? ? ?53,4
Chiều dài trung bình của một gene ?(bp) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.572
Mật độ gene (số gene/kb) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?0,42
Số lượng intron trung bình trên một gene ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?2,57
Kích thước trung bình của một intron (bp) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 97
Kích thước trung bình của một exon (bp) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?370
Số gene mã hóa tRNA ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 269
