Theo tôi thì định danh vsv đến loài rất là khó, cực kỳ khó luôn. Chắc ở VN ko có nơi làm.
Tuy nhiên nếu chỉ định danh đến genus (chi) thì lại đơn giản , chỉ chạy vèo cái 16S RNA là xong.
Theo phương pháp truyền thống, để định danh, thì phải làm 1 loạt các thử sinh lý hóa... phức tạp, và cũng phải có các loài chuẩn để so sánh...
Đơn giản nhất nhưng tốn nhiều tiền, là lai DNA/DNA . Cái này gửi dịch vụ họ làm cho. Cứ chọn con nào mà 16S RNA giống 99,99-100% thì đem lai, kết quả nào >70%, thì là loài cũ, còn <70% thì là loài mới.
NOTE: nếu có 10 loài DNA 16S 100%, thì lấy cả 10 loài ra mà thử (phải mua), nhưng mà chắc tốn vài chục nghìn USD