Cần chủng vi sinh vật thì làm thế nào?

Dương Văn Cường

Dương Văn Cường

Administrator
Staff member
Hiện giờ em cần vài genes trong genome của con Erwinia herbicola mà không biết làm thế nào để có chủng vi khuẩn này.

Trong nước có Bảo tàng giống chuẩn vi sinh vật, em đã lên website của họ search nhưng không có chủng em cần.

Liệu trên thế giới có cái ngân hàng nào lưu giữ các chủng giống vi sinh vật để khi cần nhà nghiên cứu có thể đặt hàng không nhỉ? Em đã google thử nhưng không thấy.
 
Dương Văn Cường said:
Hiện giờ em cần vài genes trong genome của con Erwinia herbicola mà không biết làm thế nào để có chủng vi khuẩn này.

Trong nước có Bảo tàng giống chuẩn vi sinh vật, em đã lên website của họ search nhưng không có chủng em cần.

Liệu trên thế giới có cái ngân hàng nào lưu giữ các chủng giống vi sinh vật để khi cần nhà nghiên cứu có thể đặt hàng không nhỉ? Em đã google thử nhưng không thấy.
Click to expand...

Cuong:
Duoi day la mot list cua cac ngan hang luu tru giong vi sinh vat. Em co the vao website cua ho de search giong vi sinh vat trong collection cua ho.

Chuc may man,

===============

Australia: Lady Mary Fairfax Cellbank Australia (CBA); The National Measurement Institute
(NMI);
Belgium: Belgian Coordinated Collections of Microorganisms (BCCMTM);
Bulgaria: National Bank for Industrial Microorganisms and Cell Cultures (NBIMCC);
Canada: International Depositary Authority of Canada (IDAC);
China: China Center for Type Culture Collection (CCTCC); China General Microbiological
Culture Collection Center (CGMCC);
Czech Republic: Czech Collection of Microorganisms (CCM);
France: Collection nationale de cultures de micro-organismes (CNCM);
Germany: DSMZ - Deutsche Sammlung vonMikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ);
Hungary: National Collection of Agricultural and Industrial Microorganisms (NCAIM);
India: Microbial Type Culture Collection and Gene Bank (MTCC);
Italy: Advanced Biotechnology Center (ABC); Collection of Industrial Yeasts DBVPG;
Japan: International Patent Organism Depositary (IPOD), National Institute of Advance
Industrial Science and Technology (AIST); National Institute of Technology and Evaluation,
Patent Microorganisms Depositary (NPMD);
Latvia: Microbial Strain Collection of Latvia (MSCL);
Netherlands: Centraalbureau voor Schimmelcultures (CBS);
Poland: IAFB Collection of Industrial Microorganisms; Polish Collection of Microorganisms
(PCM);
Republic of Korea: Korean Cell Line Research Foundation (KCLRF); Korean Collection for
Type Cultures (KCTC); Korean Culture Center ofMicroorganisms (KCCM);
Russian Federation: National Research Center of Antibiotics (NRCA); Russian Collection of
Microorganisms (VKM); Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM);
Slovakia: Culture Collection of Yeasts (CCY);
Spain: Banco Nacional de Algas (BNA); Colección Española de Cultivos Tipo (CECT);
United Kingdom: CABI Bioscience, UK Centre (IMI); Culture Collection of Algae and
Protozoa (CCAP); European Collection of Cell Cultures (ECACC); National Collection of
Type Cultures (NCTC); National Collection of Yeast Cultures (NCYC); National Collections
of Industrial, Food and Marine Bacteria (NCIMB); National Institute for Biological Standards
and Control (NIBSC);
United States of America: Agricultural Research Service Culture Collection (NRRL);
American Type Culture Collection (ATCC).
 
ở DSMZ cũng khá nhanh đấy, giá cả phải chăng, ở UK đặt ở đây chắc 3-4 ngày. DSMZ - Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen http://www.dsmz.de/
Lần trước em đặt chỗ này gần nhà nên nhanh....mà ở Đức hầu như chỉ đặt chỗ này. em nghĩ Uk thiếu gì hả trời !
 
Dương Văn Cường said:
Em biết ạ. Em cần 3 genes mà gene nào cũng từ 1kb đến 2kb, nếu đặt tổng hợp thì đắt quá.
Click to expand...

Hi Cuong: I understand your money concern. Just remember that costs of gene synthesis per bases pair have fallen significantly. I believe that it is now around 35-40 cents/bp. In addition, you can have them synthesized and shipped to your lab within a week or two (including codon optimization and sequencing confirmation), and they would come with the cloning sites of choice.
On the other hand, it may take much longer if you do it the traditional way (fill out the paperwork, order the microbes, grow them up, extract DNA, order PCR primer, amplify the genes, purify and clone, re-sequence confirmation, etc.).

Chuc Cuong thanh cong,

David-
 
Chí lý đấy Cường. $0.35 x ~1000 nu x 3 = ~ $1500, còn rẻ chán!
Cái vụ vector kia về VN cũng khoảng $2750 rồi, thành thử tao đang chờ xem có ý kiến gì khác từ hãng cho sản phẩm khác giá rẻ hơn không! Nếu phải mua thế thì mày còn đủ tiền về thăm con không? :D:D
 
Hồi trước mình định làm overlap PCR để tổng hợp cái gene khoảng 300 Nu.
Nhưng rốt cục GS order cty nó tổng hợp cho luôn, hết khoảng 500 nghìn won thì phải (~400 USD)
Ở Châu Âu hình như khoảng 0.6 USD/Nu. Một cái ngặt là cty nước ngoài nó sẽ không tổng hợp một số gene làm vaccine cho mình. Phải thuê cty nội địa làm thôi.
 
voh5 said:
Chí lý đấy Cường. $0.35 x ~1000 nu x 3 = ~ $1500, còn rẻ chán!
Cái vụ vector kia về VN cũng khoảng $2750 rồi, thành thử tao đang chờ xem có ý kiến gì khác từ hãng cho sản phẩm khác giá rẻ hơn không! Nếu phải mua thế thì mày còn đủ tiền về thăm con không? :D:D
Click to expand...
0.35 x 1000 x 3 x 2 nữa ông ạ, 1 gene phải order 2 mạch oligos sau đó mới anneal với nhau thành mạch kép.

Vụ gateway bỏ đi, tao tính cách khác rồi.
 
Dương Văn Cường said:
0.35 x 1000 x 3 x 2 nữa ông ạ, 1 gene phải order 2 mạch oligos sau đó mới anneal với nhau thành mạch kép.

Vụ gateway bỏ đi, tao tính cách khác rồi.
Click to expand...
Mình không hiểu về cái này, nhưng nếu order một mạch rồi order thêm hai mồi ở hai đầu để tổng hợp mạch còn lại bằng PCR chắc sẽ rẻ hơn order một lúc hai mạch bổ sung nhau.
 
Dương Văn Cường said:
Dĩ nhiên là em tính cách này đầu tiên :D
Click to expand...
Cách này nghe thấy hay quá, bạn Cường đã có kinh nghiệm gì về vụ này thì chia sẽ cho anh em học hỏi với. Để người ta đồng ý cho mình thì thông thường đổi lại họ cần gì ở mình.
 
Ho Huu Tho said:
Cách này nghe thấy hay quá, bạn Cường đã có kinh nghiệm gì về vụ này thì chia sẽ cho anh em học hỏi với. Để người ta đồng ý cho mình thì thông thường đổi lại họ cần gì ở mình.
Click to expand...
có publish thì đừng quên tên và viện người ta.. hè hè, vụ xin xỏ gen thì em cũng đi xin rồi, nối chung hình như rất nhiều nhóm làm việc sẵn sàng chia sẻ, chia sẻ thành tựu cũng sướng mà. Nói chung chỉ cần giới thiệu nhóm làm việc, công việc mình đang làm cần đến nó như thé nào, đưa địa chỉ của mình cũng như của GS. Nếu hơi khó thì nhờ prof. viet mail xin giùm!
còn không nữa thì viết cái mail gủi toàn mail nội bộ trong trường hoặc viện... kiểu như xin hóa chất.. hỏi xem ai có thì ..share cho một ít Gen.
 
Dương Văn Cường said:
0.35 x 1000 x 3 x 2 nữa ông ạ, 1 gene phải order 2 mạch oligos sau đó mới anneal với nhau thành mạch kép.
Click to expand...

Cuong:
Dieu Ban viet o tren khong chinh xac. Khi Ban order synthetic genes, Ban se nhan duoc double stranded DNA (already cloned in a vector). Ban khong can phai lam gi them ngoai viec subcloning the insert into your expression vector.

Tuy vay, order synthetic genes thuong chi duoc ap dung khi Ban khong co nhieu thi gio. Neu Ban co thi gio thi thuc hien thi nghiem theo "traditional way" cung van tot.

Chuc thanh cong,
 
Truoc kia, Toi thuong order synthetic genes cua GeneArt. Hien nay, co nhieu cong ty offer similar services nhung Toi khong biet chat luong ra sao.
Cuong hay xin y kien cua advisor xem advisor suy nghi the nao. Vi lam viec cho industry, cach suy nghi cua Toi doi khi cung khac voi cac giao su o academia.

..."as gene synthesis becomes a commodity, biologists will spend more time designing custom DNA molecules and characterizing their performance, and less time constructing them"... (Czar et al., Gene Synthesis Demystified, Cell, 2008)

David-
 
Lê Đức Dũng said:
ở DSMZ cũng khá nhanh đấy, giá cả phải chăng, ở UK đặt ở đây chắc 3-4 ngày. DSMZ - Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen http://www.dsmz.de/
Lần trước em đặt chỗ này gần nhà nên nhanh....mà ở Đức hầu như chỉ đặt chỗ này. em nghĩ Uk thiếu gì hả trời !
Click to expand...

Update topic cho anh chị em nào quan tâm: Cuối cùng (tháng 6/2010) thì em đã mua chủng VSV ở DSMZ. Có ship về VN. Giá cả có trên website. Em mua chủng vi sinh vật lành tính nên cũng đỡ rắc rối.
 
You must log in or register to reply here.

Facebook

Thống kê diễn đàn

Threads
11,649
Messages
71,548
Members
56,917
Latest member
sv368net
Back
Top