Kỹ thuật Microaray ?

[Nguyễn Quang Hưng]

Chào các Anh Chị tiền bối ! E muốn tìm hiểu về kỹ thuật microarray nhưng kiếm tài liệu khó quá. Anh Chị nào có bài viết hay tài liệu gì chỉ cho E với !

 

[Nguyễn Trường Khoa]

Chào các Anh Chị tiền bối ! E muốn tìm hiểu về kỹ thuật microarray nhưng kiếm tài liệu khó quá. Anh Chị nào có bài viết hay tài liệu gì chỉ cho E với !

bạn thử đọc một số tài liệu sau xem có giúp gì được không (nguồn giga.ws)
Guide to Analysis of DNA Microarray Data, Second Edition
by: Steen Knudsen
en
http://rapidshare.com/files/64418681/A_Guide_to_Analysis_of_DNA.www.w5awarez.com.rar
Microarray Methods and Protocols
by: Robert S. Matson
en | CRC
http://ifile.it/iyto5g7/1420046659.rar
A Biologist's Guide to Analysis of DNA Microarray Data
by: Steen Knudsen
en
http://rapidshare.com/files/45105030/A_Biologist_s_Guide_to_Analysis_of_DNA_Microarray_Data_muya.rar
Microarray Gene Expression Data Analysis
by: Helen Causton John Quackenbush Alvis Brazma
en
http://ifile.it/8j7rnp9/1405106824.zip

 

[Nguyễn Quang Hưng]

Thanks A Khoa nhiều nhé. A Khoa ở viện DT à. Viện A đã có nghiên cứu nào về vấn đề này chưa vậy ?

 

[Đinh Duy Thành]

Chào các Anh Chị tiền bối ! E muốn tìm hiểu về kỹ thuật microarray nhưng kiếm tài liệu khó quá. Anh Chị nào có bài viết hay tài liệu gì chỉ cho E với !

Tôi nghĩ việc đầu tiên cần tìm hiểu là giá thành chạy một mẻ Microarray và kết quả nhận được từ nó (đầu tư và sản phẩm), sau đó mới tính đến những chuyện khác được.

Bạn có thể cho biết ý tưởng và dự định của bạn được không?

 

[Nguyễn Trường Khoa]

hic hic viện mình cũng có PTNTD làm về vấn đề này, nhưng mình không thuộc phòng đó.

 

[Lê Đức Dũng]

microarray, có nhiều loại như DNAmicroarray, Proteinmicroarray....., mihnf thì không biết lắm về cái này, nhưng dường như mấy cái biochip của microarray thường được cá lab mua về dùng là chính , it nghiên cứu và tự làm, có làm thi làm những của hiếm hoặc mới mà các công ti chưa làm, các công ti sẩn xuất hàng loạt bio chip bằng robot sẽ có nhiều lợi thế và mua về có lẽ là rẻ hơn tự làm
cách đây vài tháng mình cũng đang làm thêm cho 1 project về DNA Biochip của mấy chú Bacillus subtilis, mục đích của chip này là nhận diện nhanh và xác định nhanh số lượng tương đối của vk này có trong ..rác thải, (dùng chip sẽ tiết kiệm đước rát nhiều thời gian và đơn giản hơn) nhưng vì đang trục trặn một số ky thuật nên dang pause, do đó cũng chưa đọc được nhiều về cái này. mình làm chưa xông chưa hết công đoạn , nhưng thực ra về DNA biochip nó cũng khá đơn giản chứ không qua phức tạp và hầu hết đã được nghiên cứu và chỉ việc làm theo protocoll, qua trọng là phải là lab chuyên về biochip mới có đủ dụng cụng mà làm.
bạn Hưng chịu khó tìm mấy bài trên các tạp chí, mình đã có đọc qua trên mấy tạp chí nhưng không nhớ lắm nó ở đâu !

 

[Nguyễn Quang Hưng]

Thanks A Thành và A Dũng nhé. Thực ra E cũng mới chỉ tìm hiểu ở mức độ lý thuyết thôi, đọc một ít tài liệu và qua ý kiến của 2 Bác để làm được vấn đề này cũng không đơn giản phải không(trang thiết bị, máy móc....), nhưng dù sao E cũng muốn tìm hiểu... đợi đến khi có cơ hội thì thực hiện @ Bác nhỉ !

 

[Nguyễn Quang Hưng]

Các Bác có kinh nghiem chi gium E nhe!

 

[TranDucTrung]

Phải báo cho bạn Hưng tin buồn là ở VN mình chỉ mới đầu tư thiết bị và làm demo chứ chưa thấy có nghiên cứu cụ thể (ra báo cáo kết quả) thì phải. Ở cấp độ thấp hơn một chút- macroarray thì hình như bên Bách Khoa HN đã có làm về định type VSV rồi thì phải (mình nghe các thầy cô bên ấy nói vậy)
Có nhiều cơ sở nghiên cứu ở VN đã trang bị hệ thống MIcroarray như BV 108 (Affymetrix- genechip) hay Viện môi trường NN (BIORAD- spotting microarray) (cái này trước đây đặt ở VDTNN, còn giờ đang đắp chiếu ở bên đó ) hay ĐH Cần Thơ (BIORAD-nhưng chỉ có máy Scan thôi)
Quả thực Microarray rất hấp dẫn vì khả năng nghiên cứu rộng trên toàn bộ genome (biểu hiện gen, xác định gen...) nhưng ở VN mình không có nơi nào đào tạo về cái này cả. Những người biết về microarray chủ yếu theo mình biết là (1) học ở nước ngoài về, được làm hoặc ít ra được học bài bản, (2) làm ở VN, tự mày mò tìm kiếm thông tin hoặc được "lướt qua hàng nước" qua các hội thảo quảng cáo của các hãng (hình như vừa rồi ở ĐH Huế hay Đà Nẵng mới có thì phải). Cho nên thông tin về microarray ở VN rất ít. Hy vọng được chia sẻ với mọi người (mình cũng rất ham với "thằng" này)

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Phải báo cho bạn Hưng tin buồn là ở VN mình chỉ mới đầu tư thiết bị và làm demo chứ chưa thấy có nghiên cứu cụ thể (ra báo cáo kết quả) thì phải. Ở cấp độ thấp hơn một chút- macroarray thì hình như bên Bách Khoa HN đã có làm về định type VSV rồi thì phải (mình nghe các thầy cô bên ấy nói vậy)
Có nhiều cơ sở nghiên cứu ở VN đã trang bị hệ thống MIcroarray như BV 108 (Affymetrix- genechip) hay Viện môi trường NN (BIORAD- spotting microarray) (cái này trước đây đặt ở VDTNN, còn giờ đang đắp chiếu ở bên đó ) hay ĐH Cần Thơ (BIORAD-nhưng chỉ có máy Scan thôi)
Quả thực Microarray rất hấp dẫn vì khả năng nghiên cứu rộng trên toàn bộ genome (biểu hiện gen, xác định gen...) nhưng ở VN mình không có nơi nào đào tạo về cái này cả. Những người biết về microarray chủ yếu theo mình biết là (1) học ở nước ngoài về, được làm hoặc ít ra được học bài bản, (2) làm ở VN, tự mày mò tìm kiếm thông tin hoặc được "lướt qua hàng nước" qua các hội thảo quảng cáo của các hãng (hình như vừa rồi ở ĐH Huế hay Đà Nẵng mới có thì phải). Cho nên thông tin về microarray ở VN rất ít. Hy vọng được chia sẻ với mọi người (mình cũng rất ham với "thằng" này)

Microarray nghe thì to chứ thật ra cũng chẳng có gì. Hơn nữa kỹ thuật này mang tính screen để định hướng cho nghiên cứu sâu hơn. Thường cần dùng kỹ thuật này thì các nơi đều thuê công ty làm cho nhanh gọn và chuyên nghiệp.

Có 1 nghịch lý là đúng ra phải có đề tài rồi, và đề tài đó cần dùng cái máy ABC, đã tính đến hiệu suất sử dụng.... sau đó mới quyết định mua. Nhưng nhiều nơi lại theo chiến lược ngược lại, cấp tiền mua máy trước, có máy rồi mới nghĩ ra cái để làm!!!! Mà cũng phải đó là bản chất rồi, như kiểu dân mình thấy ra điện thoại, máy tính... đời mới là tậu ngay cho sành điệu, cho bà con biết rằng ta theo kịp thời đại!!!!!.

 

[TranDucTrung]

Microarray nghe thì to chứ thật ra cũng chẳng có gì. Hơn nữa kỹ thuật này mang tính screen để định hướng cho nghiên cứu sâu hơn. Thường cần dùng kỹ thuật này thì các nơi đều thuê công ty làm cho nhanh gọn và chuyên nghiệp.

Có 1 nghịch lý là đúng ra phải có đề tài rồi, và đề tài đó cần dùng cái máy ABC, đã tính đến hiệu suất sử dụng.... sau đó mới quyết định mua. Nhưng nhiều nơi lại theo chiến lược ngược lại, cấp tiền mua máy trước, có máy rồi mới nghĩ ra cái để làm!!!! Mà cũng phải đó là bản chất rồi, như kiểu dân mình thấy ra điện thoại, máy tính... đời mới là tậu ngay cho sành điệu, cho bà con biết rằng ta theo kịp thời đại!!!!!.

Bác Hưng nói Microarray đơn giản thì em nghe chừng hơi chủ quan quá. Đúng là nếu cần thì đi đặt là xong, nhưng cái này chỉ đúng với Microarray class GENECHIP thôi, mà giá thành của nó (tính trên từng thí nghiệm) thì ối giời ơi -ở trên trời, làm sao các đề tài nghiên cứu vài ba tỷ VND gánh cho đặng. Còn theo em thấy thì microarray cái khó nhất chính là phần phân tích kêt quả, chứ thao tác thì toàn máy nó làm rồi, mình chỉ cần dung đúng hóa chất mà thôi

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Bác Hưng nói Microarray đơn giản thì em nghe chừng hơi chủ quan quá. Đúng là nếu cần thì đi đặt là xong, nhưng cái này chỉ đúng với Microarray class GENECHIP thôi, mà giá thành của nó (tính trên từng thí nghiệm) thì ối giời ơi -ở trên trời, làm sao các đề tài nghiên cứu vài ba tỷ VND gánh cho đặng. Còn theo em thấy thì microarray cái khó nhất chính là phần phân tích kêt quả, chứ thao tác thì toàn máy nó làm rồi, mình chỉ cần dung đúng hóa chất mà thôi

Về việc mình nói kỹ thuật này "chẳng có gì" tất nhiên là ý kiến chủ quan của mình rồi! Tính mình vốn lạc quan, coi mọi việc đơn giản mà.

Hì hì, bạn có biết giá thành thuê công ty làm Microarray là bao nhiêu không mà nói "ở trên trời"? Đề tài vài ba tỉ đủ thuê cả chục lần. Không hiểu sao nhiều người vẫn nghĩ đề tài vài tỉ VNĐ là không đáng mấy??? Vài tỉ là một con số cực kỳ lớn và thừa đủ để làm rất nhiều việc.

 

[sv_ngheo]

Đi thuê khác gì ăn cơm bụi, cơm bụi tuy rẻ nhưng không ai ăn cơm bụi cả đời được ! cái gì cũng đi thuê trong khi đất nước còn đang nghèo rớt vậy sao ? Lôi cái đi thuê ra mà lạc quan kể cũng quá tếu, vì thuê thì người ta tiết kiệm được nguyên vật liệu, nhân công, năng lượng... nên rẻ.

Mà chỉ nên thuê khi mình đã quá rõ về công việc đó và dành time cho các nghiên cứu khác. Chứ chưa biết gì nhiều, gửi mẫu đi về mất cả tuần đến vài tuần thì còn làm quái gì nữa

Microarray ko đơn giản đâu, biết ứng dụng thì nó như một công cụ cực kỳ hiệu quả, còn không biết gì thì nó chỉ là một cái máy, cần thì đi thuê là xong.


Viện DTNN hiện có 1 máy micro array vứt xó, mua tiền tỉ về để đấy mốc meo rất phí. Đến chơi thấy thế mà xót xa

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Đi thuê khác gì ăn cơm bụi, cơm bụi tuy rẻ nhưng không ai ăn cơm bụi cả đời được ! cái gì cũng đi thuê trong khi đất nước còn đang nghèo rớt vậy sao ? Lôi cái đi thuê ra mà lạc quan kể cũng quá tếu, vì thuê thì người ta tiết kiệm được nguyên vật liệu, nhân công, năng lượng... nên rẻ.

So sánh khập khiễng và không hiểu ý người viết. Hiện giờ xu thế thế giới là hội nhập và hợp tác, đi thuê cũng là 1 kiểu hợp tác. Nếu chịu khó đọc những báo xịn như Nature, Science thì sẽ rất hiếm khi gặp những bài báo chỉ có 1 tác giả đứng tên, hoặc cả nhóm tắc giả cùng thuộc 1 phòng ban. Có hiểu vì sao không? Hiện giờ không ai người ta tự tiến hành từ A-Z 1 nghiên cứu lớn cả mà thường tập chung vào phần chính, những phần phụ khác thì thuê hoặc hợp tác để đẩy nhanh tiến độ nghiên cứu. Chứ cần dùng array thì đi tìm hiểu, mua máy, cần cytometry cũng lại tìm hiểu mua máy..... thì không thể hiệu quả được.

Mà chỉ nên thuê khi mình đã quá rõ về công việc đó và dành time cho các nghiên cứu khác. Chứ chưa biết gì nhiều, gửi mẫu đi về mất cả tuần đến vài tuần thì còn làm quái gì nữa

Tất nhiên phải hiểu rõ ý định dùng microarray làm gì thì mới đi thuê chứ.

Microarray ko đơn giản đâu, biết ứng dụng thì nó như một công cụ cực kỳ hiệu quả, còn không biết gì thì nó chỉ là một cái máy, cần thì đi thuê là xong.

Đã nói là ý kiến chủ quan mà .

Viện DTNN hiện có 1 máy micro array vứt xó, mua tiền tỉ về để đấy mốc meo rất phí. Đến chơi thấy thế mà xót xa

Đó đó, đây chính là hậu quả không chịu đi thuê!