Microarray

[Nguyễn Xuân Hưng]

Học tập tinh thần của dontcry, dạo này tôi cũng đang tập tành tìm hiểu kỹ thuật microarray. Mặc dù chả được thực nghiệm bao giờ nhưng cũng mong được trao đổi với mọi người, mong rằng là đi tắt đón đầu.

Nội dung một số phần tôi mong được trao đổi với mọi người

1. Lịch sử ra đời của kỹ thuật này
- Nghe nói nó ra đời vào đầu những năm 1990, phát triển mạnh mẽ từ năm 1995 và bùng nổ trong thời gian gần đây.
- Kỹ thuật này là sự kết hợp của các phát minh về: cấu trúc DNA, FISH, blot, blot ngược, đánh dấu huỳnh quan đa màu, robot.

2. Microarray là gì, có những loại nào?
- Đó là một giá thể rắn, ở trên gắn các mẫu dò (vì có thể gắn tới hàng chục ngàn mẫu dò trên vài cm vuông nên gọi là micro) sau đó người ta lai các trình tự đích đã đánh dấu với mảng này (giá thể + mẫu dò) và xác định tín hiệu lai.
- Microarray có mấy cách phân chia
+ Phân theo mật độ mẫu dò (mật độ thấp, cao, vừa vừa)
+ Phân theo loại mẫu dò (cell aray, glycan array, DNA array, protein array...)

3. Ứng dụng của Microarray
- Nghiên cứu biểu hiện gene
- Khám phá thuốc
- Xác định vi sinh vật
- Tái giải trình tự ???
- Nghiên cứu mức độ phân bố gene chức năng
- ......

4. Các phát triển mới của microarray
- Phát triển các phương pháp mới không cần đánh dấu trình tự đích
- Kết hợp với công nghệ nano (nanowire, nano array, cantilever chip)
- Kết hợp với các hệ thống microfluidic
- Lap on chip
.........


5. Microarray tại Việt Nam

Xin mời

 

[Nguyễn Ngọc Lương]

nghe nói viện công nghệ sinh học Việt Nam có làm sơ sơ về microarray, thử hỏi Vietbio xem?
Có đoạn đọc không hiểu về microarray: cái DNA gắn trên con chip là cái chưa biết phải không? Còn probe là cái đã biết dùng để detect expression profile của cell chứa DNA đó phải không? Thế mà sách lại bảo ngược lại, không hiểu làm sao cả?

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Có đoạn đọc không hiểu về microarray: cái DNA gắn trên con chip là cái chưa biết phải không? Còn probe là cái đã biết dùng để detect expression profile của cell chứa DNA đó phải không? Thế mà sách lại bảo ngược lại, không hiểu làm sao cả?

Probe = mẫu dò = cái đặt trên con chip = cái đã biết trong trường hợp dùng mẫu dò là oligo chỉ dài vài chục Nucleotide.
Có một cách khác là dùng mẫu dò là cDNA = cái có thể chưa biết = cái đặt trên con chip = cái để detect expression profile của tế bào thì người ta lập ra ngân hàng cDNA từ tế bào phát triển trong một điều kiện đã biết rõ, gắn nó lên con chip rồi lai với cDNA từ tế bào phát triển trong một điều kiện khác để xác định mức độ biểu hiện khác nhau.

 

[cuacang]

microaray thực ra là một chip trên đó có rất nhiều sensor (cảm biến). Khi ta cố định một chuỗi dna (enzym, cell..) lên trên bề mặt của microarray, nhờ sự lai hóa của các chuỗi dna hoặc sự tương tác của các enzyme sẽ làm cho tính chất (vật lý, hóa học) trên bề mặt micoarray thay đổi từ đó ta có thể nhận nhận biết được tín hiệu.
Hiện nay tôi biết chắc là ở Việt nam chưa chỗ nào sản xuất được microarray, có chăng thì chúng ta mua ở nước ngoài về, hiện tại chúng ta chỉ có thể sản xuất từng loại sensor chưa có đủ thiết bị để làm micorarray.

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Đánh giá bài viết
microaray thực ra là một chip trên đó có rất nhiều sensor (cảm biến). Khi ta cố định một chuỗi dna (enzym, cell..) lên trên bề mặt của microarray, nhờ sự lai hóa của các chuỗi dna hoặc sự tương tác của các enzyme sẽ làm cho tính chất (vật lý, hóa học) trên bề mặt micoarray thay đổi từ đó ta có thể nhận nhận biết được tín hiệu.
Hiện nay tôi biết chắc là ở Việt nam chưa chỗ nào sản xuất được microarray, có chăng thì chúng ta mua ở nước ngoài về, hiện tại chúng ta chỉ có thể sản xuất từng loại sensor chưa có đủ thiết bị để làm micorarray.

http://sinhhocvietnam.com/vn/module...wtopic&t=433&postdays=0&postorder=asc&start=0

 

[Hoàng Anh Hoàng]

Cơ sở lý thuyết của kĩ thuật Array đã được biết khá rõ. Ở VN theo mình biết, kĩ thuật này chưa được nghiên cứu để ứng dụng nhiều trong thực tế, có lẽ do vấn đề đầu ra và giá của thiết bị lấy mẫu còn khá đắt. Hiện nay tại Viện Công Nghệ Sinh Học và Công Nghệ Thực Phẩm trường ĐHBKHN cũng đang có những nghiên cứu array, trước mắt ở cấp độ Macroarray.

 

[Nguyễn H Phượng Uyên]

Thac mac ve microarray

chao Bac Hung,
Em da doc bai viet cua bac ve microarray roi. Cam on bac da cung cap cho em nhung kien thuc that quy bau. hien nay em cung dang lam ve DNA microaray, rat mong duoc bac giup do.
trong phan tai lieu tham khao cua bac em thay co quyen sach DNA array nhung em khong the dơnload duoc. vay neu bac co file nay thi vui long cho em xin duoc khong? cam on bac rat nhieu
Chuc bac luon vui khoe

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Chào Uyên, thật mừng khi biết phòng thí nghiệm của bạn làm về vấn đề này. Không biết bạn nghiên cứu về chế tạo array hay cố định probe hay sử dụng chip cho một mục đích cụ thể nào đó? Tôi không có nhiều kinh nghiệm nhưng có thể hỏi giúp nếu bạn thấy cần thiết.

Về cuốn sách, bạn cho biết email và tựa cụ thể cũng như NXB của cuốn sách tôi sẽ gửi.

Chúc thành công.

P/S: bạn nên sửa lại bài viết thành có dấu.

 

[Nguyễn H Phượng Uyên]

microarray

Chào bác Hưng
Trước tiên em cảm ơn bác đã sẳn sàng giúp đở em.
Hiện nay tại phòng thí nghiệm, em chỉ mới cố định được probe lên giá thể microarray bằng SiO2 và em cũng đang muốn đi tiếp nghiên cứu trong lĩnh vực này nhưng hiện nay vấn đề này tại Việy Nam chưa ai làm cả nên em chưa có điều kiện để thỉnh giáo. Nếu bác có quen biết ai hoặc bác có làm về lĩnh vực này thì cho em theo học hỏi.
Em đã đọc bài viết của bác " ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường". các tài liệu tham khảo của bác rất hay và rất có ích cho em nhưng rất tiếc em không thể lấy được vì vậy bác có thể vui lòng cho em xin những tài liệu tham khảo đó không?
Em thật sự rất cần quyển sách: " DNA Array: methods and protocols" của tác giả Rampal J.B 2001. Bác vui lòng cho em xin quyển sách này.
Xin chân thành cảm ơn bác

Phượng Uyên

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Về cuốn sách, bạn cho biết email

 

[Nguyễn H Phượng Uyên]

Địa chỉ email của em là: dianthus79@yahoo.com

Phượng Uyên

 

[Phạm Bảo Tùng]

Xin chào mọi người, tôi cũng là người đang tìm hiểu về lĩnh vực Microarray, và áp dụng của nó trong Y học, và Dược học (cụ thể là tìm ra thuốc mới và nghiên cứu dạng bào chế tại địch). Tôi rất muốn biết về tình hình nghiên cứu lĩnh vực này ở VN, vì sắp tới tôi chuẩn bị đi học về lĩnh vực này và rất lo việc khó áp dụng vào thực tế sau khi học xong.
Topic này có vẻ hơi cũ, up lại để mong chỉ giáo của các anh chị

 

[Sololist]

Về microarray thì mình từng đọc một tài liệu của TS Bùi chí bửu, Viện lúa DBSCL. Tự cảm thấy tài liệu này hay nên post lên đây tặng bạn nào muốn đọc thêm. (Mới tham gia SHVN lần đầu nên chưa quen cách post tài liệu, các bạn nếu cần nhưng không thấy tài liệu nhớ nhắc để mình post lại)
Nhân tiện các bạn cho mình hỏi: Máy microarray có rửa mẫu luôn không? Với cái này xin hỏi về lí thuyết: rửa mẫu bằng dung dịch gì và như thế nào đối với adn? protein.

 

[Tran_Quang_Binh]

Xin tài liệu về Microarray

Cám ơn anh Hưng,

Tôi đang quan tìm hiểu về microarray và ứng dụng trong y sinh học.
Mong anh gửi cho tôi tài liệu " DNA Array: methods and protocols" của tác giả Rampal J.B 2001.

Nếu anh có các tài liệu về chủ đề trên cập nhật, vui lòng gửi cho tôi.

Trân trọng cảm ơn anh.

Trần Quang Bình

binhnihe@yahoo.com

 

[Nguyễn Thy Ngọc]

Chào anh Hưng!
Em cũng đang nghiên cứu về DNA array, anh có thể cho em xin quyển " DNA Array: methods and protocols" của tác giả Rampal J.B 2001 được không ạ!
Địa chỉ email của em: thyngoc.hut@gmail.com (dân BK chính hiệu nhá )
ANh có thể giải thích qua về cái "Có một cách khác là dùng mẫu dò là cDNA = cái có thể chưa biết = cái đặt trên con chip = cái để detect expression profile của tế bào" được không ạ!
Cảm ơn anh nhiều!!