Phân tích đa hình gene

[newsunflower]

Chào các bạn, tôi đang băn khoăn một vấn đề như sau, mong các bạn giải đáp:
Tôi đang nghiên cứu phân tích đa hình trên 1 gen đã biết của vi khuẩn, mục đích nghiên cứu là xem chúng có những sai khác nào của gen đó giữa các chủng khác nhau (không biết tên chủng), tôi có thể sử dụng PCR bình thường và sequencing được không? PCR trong bài báo mà tôi dựa vào, họ thiết kề mồi khuêch đại ngay bắt đầu của gen, nếu tôi e rằng nếu dựa vào cặp mồi này thì sequencing sẽ không ổn, vì sequencing hay bị nhiễu phần đầu và phần cuối, như vậy không phân tích được dịch khung mà sẽ chỉ phân tích được đột biến điểm mà thôi. Còn tại sao tôi phải sử dụng cặp mồi này vì bước sau của đề tài là cắt RE, đưa vào vector và biểu hiện protein, vì có phần biểu hiện protein nên tôi không muốn thiết kế mồi khác khuêch đại nhưng gen thừa