tìm Tm, % GC của mồi real time pcr ntn?

[hoavokhuyet]

chào các bạn:
m đang làm khóa luận tốt nghiệp, m ko chuyên về công nghệ sinh học nên ko rõ việc tìm Tm của mồi và những tính chất của mồi bằng cách nào, có chị bảo dùng primers 3 nhưng m ko biết làm như thế nào?
mong các bạn chỉ giúp.
m đã có trình tự của gen và trình tự của mồi xuôi và mồi ngược rồi.

 

[Ho Huu Tho]

chào các bạn:
m đang làm khóa luận tốt nghiệp, m ko chuyên về công nghệ sinh học nên ko rõ việc tìm Tm của mồi và những tính chất của mồi bằng cách nào, có chị bảo dùng primers 3 nhưng m ko biết làm như thế nào?
mong các bạn chỉ giúp.
m đã có trình tự của gen và trình tự của mồi xuôi và mồi ngược rồi.

Về Tm của mồi, người ta có thể dự đoán dựa vào trình tự của nó và các thành phần của phản ứng, chẳng hạn nồng độ của các muối, nồng độ mồi,... Có nhiều mô hình để dự đoán điều này, và tất nhiên là độ chính xác của các mô hình không hoàn toàn giống nhau. Có nhiều phần mềm được xây dựng để thực hiện nhiệm vụ này, một trong số các phần mềm miễn phí có thể thực hiện được việc này là Primer3 như bạn đã biết. Mỗi phần mềm được xây dựng dựa trên một hay một số mô hình nhất định.
Có một số tính chất của mồi cần quan tâm để thiết lập một phản ứng Realtime PCR tốt, mỗi tính chất sẽ được khảo sát bằng những phương pháp khác nhau. Trong một phần mềm thường kết hợp nhiều chức năng để giúp bạn phân tích cùng lúc những tính chất này. Bạn cứ cài đặt rồi mày mò trong đó một lúc thì sẽ biết có những tính chất gì ngay thôi.

 

[Nguyễn Xuân Hưng]

Đây là 1 ví dụ: http://www6.appliedbiosystems.com/support/techtools/calc/