Tại sao DNA lại sử dụng đường 5 chứ ko phải đường 6?

[Cao Xuân Hiếu]

Tại sao DNA lại sử dụng đường 5 chứ ko phải

Hồi xưa tôi nhớ các thầy cô có giải thích "tại sao sinh vật lại lựa chọn đường 5C chứ ko phải đường 6C để dùng làm cấu trúc DNA mặc dù đường 6 thì dễ tạo ra hơn trong tế bào?" Bạn nào nhớ câu trả lời hoăc có ý tưởng gì k?

 

[Nguyễn Ngọc Lương]

Cái này dễ quá (hehe): hình như là do steric constraint (hindrance) của đường 6 (ông đường 5 vóc dáng rất gọn gàng còn ông đường 6 hai tay chống nạnh ghê quá

Ngoài lý do đó tôi không hồi tưởng được lý do nào khác mặc dù cái này đọc qua nhiều rồi.

 

[Cao Xuân Hiếu]

Vâng, câu trả lời là quá dễ và nghe rất thuyết phục. Tôi nhắc đến câu hỏi này để highlight công trình thực nghiệm mới đã chứng minh sự bất hợp lý nếu DNA chọn đường 6 làm bộ khung. Điều này cho thấy khi vấn đề đặt ra, ngoài tìm câu trả lời / giải thích hợp lý, ng ta còn cần chứng minh bằng thực nghiệm nữa.

http://pubs.acs.org/cgi-bin/asap.cgi/jacsat/asap/html/ja062548x.html

J. Am. Chem. Soc. doi:10.1021/ja062548x (2006)

An experimental rationalization of the structure type encountered in DNA and RNA by systematically investigating the chemical and physical properties of alternative nucleic acids has identified systems with a variety of sugar-phosphate backbones that are capable of Watson-Crick base pairing and in some cases cross-pairing with the natural nucleic acids. The earliest among the model systems tested to date, (4' ?6')-linked oligo(2',3'-dideoxy--D-glucopyranosyl)nucleotides or homo-DNA, shows stable self-pairing, but the pairing rules for the four natural bases are not the same as those in DNA. However, a complete interpretation and understanding of the properties of the hexapyranosyl (4' ?6') family of nucleic acids has been impeded until now by the lack of detailed 3D-structural data. We have determined the crystal structure of a homo-DNA octamer. It reveals a weakly twisted right-handed duplex with a strong inclination between the hexose-phosphate backbones and base-pair axes, and highly irregular values for helical rise and twist at individual base steps. The structure allows a rationalization of the inability of allo-, altro-, and glucopyranosyl-based oligonucleotides to form stable pairing systems.

 

[Trần Hoàng Dũng]

có thể gắn fulltext cho mọi người cùng đọc được kô?

 

[Nguyễn Viết Cường]

Mạn phép anh Hiếu dính bài fulltext lên

Em đọc qua thấy bài này có vẻ thiên về hoá nhiều, họ nghiên cứu chi tiết cấu trúc một loại phân tử ?là homo DNA (1loại nucleotide đường 6). Bọn này không có quy luật bắt cặp Watson-Crick (G-C>A-T), tạo cấu trúc xoắn yếu với mỗi vòng xoắn lên tới 120-130 Anstron..., và có vẻ không đều đặn, các liên kết purine- purine là chủ yếu (G-G~A-A>T-T) và nhiều đặc điểm khác. đúng là sự lựa chọn của thiên nhiên luôn là thích hợp nhất.