Sợi đơn DNA có phát quang khi nhuôm với Ethidium Bromai không?

[biolover]

Các bạn cho mình hỏi là sợi đơn DNA khi điện di và nhuộm gel thì nó có phát quang và cho ra band không? Các giả thuyết:
1. Sợi đơn DNA không tự bắt cặp, không tạo dimer.
2. Sợi đơn DNA có thể tự bắt cặp một phần và có thể tạo dimer
Cám ơn các bạn

 

[Nguyễn Ngọc Lương]

Khi nhuộm RNA bạn thấy băng rRNA vẫn bắt màu EtBr đấy thôi. Sở dĩ vậy là do vẫn có secondary structure trong sợi đơn. Như vậy bạn tự suy ra trường hợp DNA sợi đơn thôi.
Ví dụ trường hợp PCR-SSCP thì người ta nhuộm bằng SYBR green II.

 

[biolover]

Cám ơn anh Lương.
Theo em nghĩ thì trường hợp em hỏi sẽ có phát huỳnh quang. Tuy nhiên kích thước band sẽ ngắn hơn kích thước sợi đơn ban đầu (trường hợp cấu trúc kẹp tóc) hoặc dài hơn kích thước sợi đơn ban đầu (trường hợp dimer). Đúng ko anh?

 

[Nguyễn Ngọc Lương]

Khi điện di sợi đơn thì chẳng biết nó chạy như thế nào đâu. Trường hợp SSCP đấy: 2 sợi cùng chiều dài chỉ khác nhau 1 vài vị trí đã chạy với tốc độ khác nhau rồi.