trantoan2711
Junior Member
Giải trình tự tự động (sequencing) trên máy chủ yếu tuân thủ theo các bước cơ bản như sau:
1) Chạy PCR để khuếch đại gen hoặc đoạn ADN mong muốn từ hệ gen của sinh vật.
2) Làm sạch sản phẩm PCR thu được, thường là dùng kit.
3) Chạy phản ứng Sequencing theo kit hỗ trợ của từng hãng bán máy.
4) Làm sạch sau phản ứng Sequencing có thể bằng cồn theo phương pháp truyền thống hoặc bằng Kit của hãng.
5) Chạy giải trình tự trên máy giải trình tự.
Mỗi khâu lại có quy trình hướng dẫn riêng. Hiện ở Phòng tôi (Phòng thí nghiệm trọng điểm, Viện Chăn nuôi, Hà nội) có hai máy giải trình tự ABI-3130 và CEQ-8000 . Chúng tôi đã làm nhiều về Sequencing và Microsattlite trên hai máy này. Bạn có thể liên hệ với chúng tôi để hiểu biết thêm.
Thực tế việc giải trình tự với số lượng mẫu ít là rất tốn kém. Hiện tại ở một số nơi có dịch vụ giải thuê, chi phí khoảng 300k cho một trình tư giải một chiều. Nhưng có thể chất lượng không được tốt lắm do khâu làm sạch cuối cùng sau phản ứng Sequencing thường làm bằng cồn, (khâu này đã được hãng cải tiến và sử dụng bằng kit). Bạn có thể gửi đi Hàn Quốc (như Microgen). Giá giải trình tự một chiều là 5$ cộng với 2$ làm sạch PCR, bạn phải support PCR tối thiểu 50µl và phải làm khô trong quá trình vận chuyển, cộng với chi phí vận chuyển thêm vào.
Hiện ở chỗ chúng tôi thường giải trình tự trên máy ABI-3130, có sử dụng kit làm sạch sau phản ứng sequencing lên chất lượng đã được kiểm định là như của Microgen. (kết quả đã được chứng nhận bởi Viện INRA -France). Ai có nhu cầu hoàn toàn có thể liện hệ với chúng tôi để được hỗ trợ về mặt kĩ thuật và làm dịch vụ. Hiện ở Phòng chúng tôi mỗi mẫu giải trình tự một chiều với giá khoảng 250k, giá thành sẽ giảm nếu số lượng mẫu của các bạn lớn.
Người liên hệ : Ths. Trần Xuân Toàn
email: trantoan2711@gmail.com
Mobile: 0988262855
Tel: 0438386128
Ảnh hai máy giải trình tự tự động hiện có tại phòng Trọng điểm Công nghệ tế bào động vật, Viện chăn nuôi.
1) Chạy PCR để khuếch đại gen hoặc đoạn ADN mong muốn từ hệ gen của sinh vật.
2) Làm sạch sản phẩm PCR thu được, thường là dùng kit.
3) Chạy phản ứng Sequencing theo kit hỗ trợ của từng hãng bán máy.
4) Làm sạch sau phản ứng Sequencing có thể bằng cồn theo phương pháp truyền thống hoặc bằng Kit của hãng.
5) Chạy giải trình tự trên máy giải trình tự.
Mỗi khâu lại có quy trình hướng dẫn riêng. Hiện ở Phòng tôi (Phòng thí nghiệm trọng điểm, Viện Chăn nuôi, Hà nội) có hai máy giải trình tự ABI-3130 và CEQ-8000 . Chúng tôi đã làm nhiều về Sequencing và Microsattlite trên hai máy này. Bạn có thể liên hệ với chúng tôi để hiểu biết thêm.
Thực tế việc giải trình tự với số lượng mẫu ít là rất tốn kém. Hiện tại ở một số nơi có dịch vụ giải thuê, chi phí khoảng 300k cho một trình tư giải một chiều. Nhưng có thể chất lượng không được tốt lắm do khâu làm sạch cuối cùng sau phản ứng Sequencing thường làm bằng cồn, (khâu này đã được hãng cải tiến và sử dụng bằng kit). Bạn có thể gửi đi Hàn Quốc (như Microgen). Giá giải trình tự một chiều là 5$ cộng với 2$ làm sạch PCR, bạn phải support PCR tối thiểu 50µl và phải làm khô trong quá trình vận chuyển, cộng với chi phí vận chuyển thêm vào.
Hiện ở chỗ chúng tôi thường giải trình tự trên máy ABI-3130, có sử dụng kit làm sạch sau phản ứng sequencing lên chất lượng đã được kiểm định là như của Microgen. (kết quả đã được chứng nhận bởi Viện INRA -France). Ai có nhu cầu hoàn toàn có thể liện hệ với chúng tôi để được hỗ trợ về mặt kĩ thuật và làm dịch vụ. Hiện ở Phòng chúng tôi mỗi mẫu giải trình tự một chiều với giá khoảng 250k, giá thành sẽ giảm nếu số lượng mẫu của các bạn lớn.
Người liên hệ : Ths. Trần Xuân Toàn
email: trantoan2711@gmail.com
Mobile: 0988262855
Tel: 0438386128
Ảnh hai máy giải trình tự tự động hiện có tại phòng Trọng điểm Công nghệ tế bào động vật, Viện chăn nuôi.
