"Pathway activation"

[pththao]

A cell-culture phenotype, such as pathway activation, is difficult to represent in a diverse sample such as a tumor.

Xin hỏi mọi người "pathway activation" là phương pháp thế nào. Mình đã tra trên wikipedia nhưng không thấy có từ này. Thanks.

 

[Ho Huu Tho]

Xin hỏi mọi người "pathway activation" là phương pháp thế nào. Mình đã tra trên wikipedia nhưng không thấy có từ này. Thanks.

Theo mình thì "pathway activation" là một ví dụ về kiểu hình, có thể được hiểu là "sự hoạt hóa của con đường tín hiệu". Để tìm hiểu về con đường tín hiệu bạn thử tham khảo thêm bài này xem: Phát tín hiệu và truyền tin

 

[Nguyễn Ngọc Lương]

Cái đó đâu phải là phương pháp, mà là một phenotype (tính trạng). Chữ "such as" là dấu hiệu để chỉ chữ kế tiếp sau là ví dụ của chữ đi trước.

 

[pththao]

Cái đó đâu phải là phương pháp, mà là một phenotype (tính trạng). Chữ "such as" là dấu hiệu để chỉ chữ kế tiếp sau là ví dụ của chữ đi trước.

Xin lỗi tôi dùng từ sai vì đang nghĩ đến vấn đề phương pháp trong ngữ cảnh ở đoạn trước: phương pháp dựa trên nhân định về hình thể của mô + các phương pháp hoá học khác nhau so với gene expression. Vì vậy mình hiểu pathway activation là một kiểu quan sát, hoặc đo đạc một khía cạnh nào đó trên phenotype, nhưng không biết nó cụ thể là cái gì.
Đây là nguyên văn đoạn trích từ Nature Review Genetics 8 602 (2007) mà mình chưa hiểu rõ ý lắm:

The power of the expression signature is twofold. First, the enormous complexity of the expression data that can be sampled provides the opportunity to identify patterns of expression that reflect subtle distinctions in biology. The main limitation lies in the capacity to define the bio- logical state of interest, whether through the generation of distinct experimental states that can then be used to train an analysis of expression, or by taking advantage of exist- ing biological conditions that can be used as the training opportunity. Second, the expression signature is portable in the sense that it can be assayed in varied contexts — an expression signature that is developed in a cell-culture context can be measured in a tumour or a histological section. As such, the expression signature provides a link between otherwise heterologous systems. A cell-culture phenotype, such as pathway activation, is difficult to rep- resent in a diverse sample such as a tumour. By contrast, an expression profile provides a mechanism to link these two states — the profile represents pathway activation in the cell culture that can then be used to interrogate the expression data from a tumour. In a sense, the gene expression signature becomes the common currency to connect the experimental state with the in vivo state.

Cảm ơn replies
Mình sẽ tìm hiểu thêm về giải thích của bạn Ho Huu Tho