What's new

Thiết kế mồi cho phản ứng PCR

thayboi8x

Member
#1
ai co thê? thiểt kế mồi hộ minh cho đoạn gen sau
mình đã thiết kế bằng Prime 3 nhung mà chiều dài sản phẩm quá ngắn.còm bàng phầm mềm trên trang http://www.yeastgenome.org/cgi-bin/web-primer
thì chạy PCR vẵn ko ra
mình nghĩ chắc phải thiết kế bằng tay mới dc
1 gatctggggc atttgtccaa cgaagcgacc ggcgagctga tgagcgaaat tctgaacttc
61 cgtctgaagc gggtgtactt ggcgcatttg agccgcgagc acaaaatgct cgacctggcc
121 aaaatgtgcg tgcgcacggc catggaggac cgtggctgct tctacaagga cagcgagtcc
181 aagctgtgcg acacgtatta cgaccgcccg acgccctggg atgtgctgaa ggagcggtga
241 ttgttggcag tgaaaccggc catgatggtt atatctactt acctatctat ggcgatccat
301 ttaatttata ttgagagggg attgtgtcgt ggatgaatgt atcagtcagg caaggacaag
361 gtgttattta ttcggaaaaa tagaaaaaca cggcctcccg tacgtcattg caaatgacag
421 gggggccttt ttagcttctg cgctaacggt tagtagtgat aacgcttatt gggcctctat
481 gacggtgttt ctttttctac ctgttggaaa attccaaatt tagtattgac ttgtcctcat
541 cgcggatggt atttttagga aagaaaccgg tttccttgaa ttgtgtaagc gttttattgt
601 tgcgtctgcc attctgactc cggcggttgc gcacccgcct tatcaggtta ggcaggctcg
661 actcccaaag atcggcagaa catttgagag gagaggtagg acaatgaaat cgcggtacaa
721 acgtttgacc tccctggcgc tttcgctgag tatggcgttg gggatttcac tgcccgcatg
781 ggcatcaccc gatacgagcg tggacaacaa ggtcaatttc agtacggacg tcatctatca
841 gattgtgacc gaccgcttcg cggacgggga caggacgaac aatccggcgg gggatgcgtt
901 cagcggcgac cgatccaatt tgaagctcta tttcggggga gactggcagg ggattatcga
961 caagattaac gacggttatt tgaccggcat gggcgtcacc gccctctgga tatcccagcc
1021 tgtggaaaat atcacctccg tcatcaagta ttccggcgtt aacaatacgt cttatcacgg
1081 ttactgggcg agggatttta agcaaaccaa cgacgctttc ggggattttg ccgattttca
1141 aaatctgatt gatacggctc acgctcataa catcaaggtc gtgatcgact tcgcccccaa
1201 ccacacgtct ccggccgaca gggacaaccc cggcttcgcc gagaacggtg cgctgtatga
1261 taacggttcg ctgctcggcg cctacagcaa tgatacggcc ggccttttcc atcataacgg
1321 ggggaccgat ttttccacga ttgaagacgg tatttacaag aacctctacg acctggcgga
1381 catcaaccat aacaacaacg ctatggacgc ttattttaaa agcgctatcg acctttggct
1441 cggcatgggt gtggacggga ttcgttttga cgcggtgaag catatgcctt tcggctggca
1501 aaaaagcttc gtttcctcga tttacggcgg cgatcatccg gtatttacgt tcggggaatg
1561 gtatcttggc gcggatcaaa ccgacggaga caacattaaa ttcgccaacg aaagcgggat
1621 gaacctgctg gactttgaat acgcgcagga agtgcgcgaa gtgttccggg acaaaacgga
1681 aacgatgaag gatctctatg aggtgctggc cagcacggag tcgcaatacg actacatcaa
1741 caatatggtg accttcatcg acaaccatga tatggaccgg ttccaggttg ccggttccgg
1801 tacgcgggcg accgagcaag cgttggcgct gacgctgact tcccgcggcg tgccagccat
1861 ctactacggc acggagcagt acatgaccgg cgatggcgac cccaacaacc gggcgatgat
1921 gacctcgttt aataccggga cgacggctta taaagtgatt caggcattgg cgccgctgcg
1981 taaatccaat ccggccatcg cttatgggac gacgacagag cgctgggtta acaacgatgt
2041 gttgattatt gaacgcaaat tcggcagcag cgccgctttg gtggcgatta atcgaaactc
2101 gtccgccgct tatccgattt cgggtctgtt gagttcgctg ccggcgggca cttattcgga
2161 tgtattgaac ggactcttaa acggcaactc cattaccgtg ggcagcggcg gcgccgtcac
2221 caactttacg ctggcggccg gcggcacggc ggtatggcag tacacagcgc cggaaacgtc
2281 gccggcgatc ggcaatgtgg gtcccaccat gggccagccg gggaatatag tgacgattga
2341 cggccgcggc tttggcggca cggcgggcac ggtttatttc gggacgacgg cggtgaccgg
2401 ctccggcatc gtaagctggg aggacacgca gattaaggcg gtcataccga aggtcgcggc
2461 gggcaaaacg ggcgtatcgg tcaaaacgtc gtccggcacc gccagcaata cattcaaaag
2521 cttcaatgta ctgacggggg atcaggtcac ggtgcgtttc ctggtcaatc aagccaatac
2581 caattacgga acaaatgttt atcttgtcgg caacgccgcc gagctcggct cctgggaccc
2641 gaacaaagcg attgggccga tgtacaatca ggtgatcgcc aagtacccgt cctggtatta
2701 cgatgtcagc gtgccggcgg ggacaaagct ggattttaaa tttattaaaa agggcggcgg
2761 tacggtgact tgggaaggcg ggggcaacca tacgtacacg acgccggcca gcggcgtagg
2821 gacggtgacg gtggactggc aaaattaagc ggctaagcgg ccggcctgaa cgagaggcat
2881 ccggcaaaaa actgcggccg gcagttaaag tcgacgtgca aacgtgccgg ggaggattgt
2941 gaaatacagg tgcaggatct ctgctgccgg agggcaagcg gagatcccgc gttttctttg
3001 tatgcgctta aatttccagc ttttg
 

nalsinhk

Member
ai co thê? thiểt kế mồi hộ minh cho đoạn gen sau
mình đã thiết kế bằng Prime 3 nhung mà chiều dài sản phẩm quá ngắn.còm bàng phầm mềm trên trang http://www.yeastgenome.org/cgi-bin/web-primer
thì chạy PCR vẵn ko ra
mình nghĩ chắc phải thiết kế bằng tay mới dc


nhiều lắm bạn ơi, mình nghĩ là bạn chưa chú í các thông số của nó, nên nó không cho kết quả thôi. mình vừa cho chạy thử nó ra nhiều lắm. mình sẽ thiết kế giúp cho. vấn đề là mình cần biết bạn muốn mồi như thế nào: dài bao nhiêu, đoạn trình tự nhân lên dài bao nhiêu.
còn chạy PCR ko khó đâu, mình nghĩ chạy ko ra là do mình thôi, cái chính là mình phải biết cách tối ưu, cái này thì cũng cần kinh nghiệm nữa thì sẽ mất ít công sức hơn.
 
Mục đích của A là gì? Thiết kế mồi cần có mục đích cụ thể, xong rồi theo tiêu chuẩn thiết kế mồi mà làm chứ có gì đâu nhỉ.:cuta:
 

Facebook

Top