Có bạn nào có kinh nghiệm làm việc trên ExPASy và SRS server thì post lên cho bà con tham khảo với.
Expasy và SRS server
- Thread starter Cao Xuân Hiếu
- Start date
Đặng Trần Hoàng
Senior Member
Đặng Trần Hoàng
Senior Member
Một số tools từ ExPASy
Khi truy cập vào ExPASy thì phần mà mọi người thường hay sử dụng nhất đó là: Proteomics and sequence analysis tools
trong phần này bạn có thể sử dụng một số công cụ phổ biến dùng cho DNA & protein analysis:
- DNA to Protein: dịch mã từ ADN ra protein, khi paste trình từ nucleotit vào box sẽ có 3 lựa chọn, nếu để mặc định thì output sẽ chỉ có trình tự protein, nếu chọn "Includes nucleotide sequence" thì output sẽ gồm trình tự nucleotit tương ứng với trình tự protein.
- BLAST: dùng cho search trình tự protein
- ALIGNMENT: SIM dùng cho so sánh trình tự 2 protein, ClustalW
- Primary structure analysis: Compute pI/MW rất hay cho tính toán giá trị pI và MW của một trình tự protein.
Khi truy cập vào ExPASy thì phần mà mọi người thường hay sử dụng nhất đó là: Proteomics and sequence analysis tools
trong phần này bạn có thể sử dụng một số công cụ phổ biến dùng cho DNA & protein analysis:
- DNA to Protein: dịch mã từ ADN ra protein, khi paste trình từ nucleotit vào box sẽ có 3 lựa chọn, nếu để mặc định thì output sẽ chỉ có trình tự protein, nếu chọn "Includes nucleotide sequence" thì output sẽ gồm trình tự nucleotit tương ứng với trình tự protein.
- BLAST: dùng cho search trình tự protein
- ALIGNMENT: SIM dùng cho so sánh trình tự 2 protein, ClustalW
- Primary structure analysis: Compute pI/MW rất hay cho tính toán giá trị pI và MW của một trình tự protein.
Similar threads
