Đặng Trần Hoàng
Senior Member
Lại nói tiếp về Bioinformatics!!!
To VanKiemsau:
Nếu nói một cách "đơn thuần" thì một phòng thí nghiệm về Bioinformatics chỉ là một phòng máy tính với các máy tính kết nối với Internet. Hiểu như vậy là đúng nhưng không trúng, bởi vì như tôi đã nói, trong lĩnh vực Bioinformatics chúng ta sẽ xử dụng các thế mạnh của Tin học để giải quyết các vấn đề của Sinh học. Có rất nhiều phần mềm miễn phí đã được viết ra cho nhiều mục đích khác nhau nhưng những phần mềm đó mới chỉ giải quyết được những vấn đề đơn giản chẳng hạn như so sánh trình tự (BLAST), dịch mã ADN to protein và ngược lại, thiết kế mồi, tìm vị trí cắt của các enzyme giới hạn.... Tuy nhiên, khi phải xử lý các vấn đề khá phức tạp khác như mô phỏng sinh học chẳng hạn thì phải cần đến những phần mềm chuyên dụng (tất nhiên là không thể miễn phí được) và những hệ máy tính có tốc độ xử lý tương đối mạnh để giải quyết.
Ngoài ra, một mảng cũng không kém phần quan trọng trong Bioinformatics đó là xây dựng các database. CSDL của NCBI cũng là một dạng database nhưng đó là một ngân hàng dữ liệu tương đối lớn mà đôi khi chúng ta như "bơi" trong đó. Khi chúng ta nghiên cứu một đối tượng sinh học nào đó, chúng ta cần biết các thông tin về bản thân đối tượng đó chẳng hạn: tên loài xuất xứ, các thông số về hóa-lý, các đặc điểm nhận dạng....tất cả những cái đó là thành phần của một database. Giả sử như bạn đang nghiên cứu về một gen nào đó thì việc tập hợp các nguồn thông tin về nguồn gốc của gen từ các loài khác nhau, đặc điểm của gen đó..vào trong một database sẽ giúp chúng ta dễ dàng lưu trữ cũng như tìm kiếm khi cần thiết. Và chính mục đích này mới thực sự cần thiết khi thiết lập các CSDL trong sinh học.
VanKiemsau said:
To VanKiemsau:
Nếu nói một cách "đơn thuần" thì một phòng thí nghiệm về Bioinformatics chỉ là một phòng máy tính với các máy tính kết nối với Internet. Hiểu như vậy là đúng nhưng không trúng, bởi vì như tôi đã nói, trong lĩnh vực Bioinformatics chúng ta sẽ xử dụng các thế mạnh của Tin học để giải quyết các vấn đề của Sinh học. Có rất nhiều phần mềm miễn phí đã được viết ra cho nhiều mục đích khác nhau nhưng những phần mềm đó mới chỉ giải quyết được những vấn đề đơn giản chẳng hạn như so sánh trình tự (BLAST), dịch mã ADN to protein và ngược lại, thiết kế mồi, tìm vị trí cắt của các enzyme giới hạn.... Tuy nhiên, khi phải xử lý các vấn đề khá phức tạp khác như mô phỏng sinh học chẳng hạn thì phải cần đến những phần mềm chuyên dụng (tất nhiên là không thể miễn phí được) và những hệ máy tính có tốc độ xử lý tương đối mạnh để giải quyết.
Ngoài ra, một mảng cũng không kém phần quan trọng trong Bioinformatics đó là xây dựng các database. CSDL của NCBI cũng là một dạng database nhưng đó là một ngân hàng dữ liệu tương đối lớn mà đôi khi chúng ta như "bơi" trong đó. Khi chúng ta nghiên cứu một đối tượng sinh học nào đó, chúng ta cần biết các thông tin về bản thân đối tượng đó chẳng hạn: tên loài xuất xứ, các thông số về hóa-lý, các đặc điểm nhận dạng....tất cả những cái đó là thành phần của một database. Giả sử như bạn đang nghiên cứu về một gen nào đó thì việc tập hợp các nguồn thông tin về nguồn gốc của gen từ các loài khác nhau, đặc điểm của gen đó..vào trong một database sẽ giúp chúng ta dễ dàng lưu trữ cũng như tìm kiếm khi cần thiết. Và chính mục đích này mới thực sự cần thiết khi thiết lập các CSDL trong sinh học.
Bac aigu oi, neu em chay PDB viewer for protein modelling dung computer (pen II, 200) có được không hả bác?. 
