Go Back   Diễn đàn Sinh học Việt Nam > Giảng đường > Di truyền - Sinh học phân tử

Di truyền - Sinh học phân tử Do hai bộ môn này khá gần nhau nên chúng được nhập chung vào một diễn đàn

 
Trả lời
 
Ðiều Chỉnh Xếp Bài
Old 06-01-16, 17:11   #1
DiuPham689
Registered Users
 
DiuPham689's Avatar
 
Tham gia ngày: Jan 2013
Bài gửi: 1
Thanks: 0
Thanked 0 Times in 0 Posts
Dear các cao thủ,
Bác nào giải thích giúp em về các lựa chọn khi điền form giải trình tự NGS là - Whole genome De Novo Sequencing và Whole genome resequencing. Theo em hiểu là nếu mẫu của mình đã biết trình tự tham chiếu (có nghĩa là đã từng giải trình tự hoặc mình biết trình tự) thì chọn thằng resequencing. còn nếu mẫu của mình là mẫu mới giải trình tự (chưa có trình tự tham chiếu/chưa giải trình tự bao giờ) thì chọn de novo sequencing đúng không ?
Thanks all
DiuPham689 is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn

Sponsored Links
Old 06-01-16, 18:38   #2
lovekieu
Thành viên
 
lovekieu's Avatar
 
Tham gia ngày: Oct 2010
Bài gửi: 29
Thanks: 0
Thanked 13 Times in 6 Posts
Trích:
Nguyên văn bởi DiuPham689 View Post
Dear các cao thủ,
Bác nào giải thích giúp em về các lựa chọn khi điền form giải trình tự NGS là - Whole genome De Novo Sequencing và Whole genome resequencing. Theo em hiểu là nếu mẫu của mình đã biết trình tự tham chiếu (có nghĩa là đã từng giải trình tự hoặc mình biết trình tự) thì chọn thằng resequencing. còn nếu mẫu của mình là mẫu mới giải trình tự (chưa có trình tự tham chiếu/chưa giải trình tự bao giờ) thì chọn de novo sequencing đúng không ?
Thanks all
chuẩn không cần hỏi, Tuy nhiên tại sao phải chọn vì giải trình tự bằng NGS nó liên quan đến cồn suất máy chạy. mẫu chạy De novo yêu cầu lượng coverage phải lớn từ 100 - 200 thì mới phân tích được. Còn resequencing thì chỉ cần coverage khoảng 40 là đủ.
lovekieu is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Trả lời

Ðiều Chỉnh
Xếp Bài

Chuyển đến


vB 3.8.7 Copyright © 2000 - 2017, Jelsoft Enterprises Ltd.